1823-ban a Körösök vízvidékének sikeres térképezése után helyezték át a Dunához, a folyó vízrajzi felmérésének (mappációjának) lebonyolítására. Mindeközben elfogadták a szintezőműszerek korszerűsítésére tett javaslatait is, valamint az ő ajánlására alkalmazták a 10-es számrendszerű beosztást a szintezőléceken a korábbi 6-12-es számrendszer helyett. Habár akkoriban Huszár egyedülálló képzettséggel és gyakorlattal rendelkezett a geodéziai felmérésekben, tanítványa és munkatársa, Vásárhelyi Pál rövid idő alatt kiváló szakemberré vált és át is vette helyét a Duna vízrajzi felmérésének irányításában. Huszár Mátyást pedig visszaküldték Nagyváradra a Körösök szabályozásához. Ebben közrejátszottak korábbi összetűzései az osztrák karhatalommal, így később még ezt a munkakört is kivették a kezéből. Mellőzve, anyagilag háttérbe szorítva, elfeledve halt meg Nagyváradon.